在 取得成绩的同时，问题也不可忽视。去年底，九大湖泊还有四个水质属于劣五类。按照云南省要求，异龙湖2013年要达到四类水质标 准；滇池35条入湖河道不低于四类水；5年后，滇池、异龙湖、杞麓湖都要保住五类水，力争四类水；洱海、阳宗海要稳住二类水；星云湖、程海要稳住三类水； 抚仙湖、泸沽湖要稳住一类水；九湖流域消灭劣五类水体的目标，实现水质改善新突破。

去年年底，云南省政府提出了下一阶段污染综合防治的重点：

滇池是国家治理重点湖泊和云南省治理首要湖泊。要重点解决城市生活污染、农业农村面源污染、工业污染和内源污染问题，力争成为国家“三河三湖”治理典范。

抚仙湖、泸沽湖为重点保护型湖泊。要重点解决抚仙湖北岸城镇生活污染、农业农村面源污染问题和泸沽湖旅游污染、农业农村面源污染问题。

洱海、程海、阳宗海为云南省预防型湖泊。洱海流域要重点解决奶牛养殖污染、农业农村面源污染问题，程海流域要重点解决水土流失、农业农村面源污染问题，阳宗海流域要重点解决工业污染、砷污染问题。

异龙湖、杞麓湖、星云湖为重点治理型湖泊。异龙湖要重点解决水产养殖污染、城镇污染、豆腐加工污染、农业农村面源污染问题；星云湖流域要重点解决仔猪养殖污染、城镇生活、农业农村面源污染；杞麓湖流域要重点解决蔬菜种植污染、城镇生活污染问题。